Тесты на основе CRISPR для обнаружения инфекций вируса BK и вируса JC после трансплантации почки

Yu Liu ,  

Jing-Song Xu ,  

Li Cao ,  

Shuang Yang ,  

Tian-Ming Li ,  

Hai-Qian Huang ,  

Jun-Heng Zhang ,  

Xue Zhao ,  

Qian Liu ,  

Shun Li ,  

Min Li ,  

Hua Wang ,  

Abstract

Реципиенты трансплантации органов сталкиваются с серьезными рисками острых или хронических инфекций, угрожающих сохранению трансплантата. Вирус BK (BKV) и вирус JC (JCV) являются двумя важными оппортунистическими вирусами, которые могут вызывать вирусную нефропатию, связанную с полиомавирусами, и потерю трансплантата почки у пациентов, находящихся в иммуносупрессивном состоянии после трансплантации почки. Поэтому своевременное обнаружение и постоянный мониторинг вирусной нагрузки крайне необходимы. Однако текущие диагностические методы ограничены, и разработка новых молекулярных технологий детекции чрезвычайно актуальна. Были оптимизированы последовательности и концентрации РНК CRISPR (crRNA), концентрация Cas13a и праймеры для амплификации полимеразой рекомбинанты (RPA) для обнаружения BKV и JCV. Далее была разработана и изготовлена новая микрофлюидная двукапельная чип-система, интегрированная с CRISPR (ddCRISPR) для одновременного качественного обнаружения BKV и JCV. Затем анализ ddCRISPR был проверен на клинических образцах. После этого для обнаружения BKV и JCV в условиях с ограниченными ресурсами была разработана полоска бокового потока в сочетании с CRISPR (LFCRISPR). Был создан и оптимизирован одноконтейнерный реакционный набор RPA-CRISPR для обнаружения BKV и JCV. ddCRISPR может одновременно и быстро определять BKV и JCV с высокой чувствительностью (10 копий/мл для BKV и 1 копия/мл для JCV) и обеспечивать абсолютное количественное определение, что подходит для детекции вирусной нагрузки и способствует персонализированному и точному лечению реципиентов трансплантации органов. LFCRISPR упрощает операционный процесс за счет простого визуального считывания, облегчая скрининг вирусов после трансплантации органов. Эти платформы интегрируют молекулярное тестирование в модель лечения трансплантации, снижая затраты, продлевая срок службы трансплантата, улучшая клинические результаты послеоперационного ведения при трансплантации почки и повышая качество жизни пациентов.

Keywords

вирус BK (BKV); вирус JC (JCV); трансплантация почки; короткие регулярно расположенные повторяющиеся палиндромические последовательности (CRISPR); микрофлюидика; тест бокового потока (LFA)

READ MORE